สำนักงานมหาวิทยาลัย (ชื่อเดิมสำนักงานอธิการบดี) เป็นหน่วยงานบริหารของวิทยาลัยครูสวนดุสิตที่จัดตั้งขึ้นตามพระราชบัญญัติวิทยาลัยครู พ.ศ. 2518 และต่อมาในปี พ.ศ. 2538 ต่อมาวันที่ 15 มิถุนายน 2547 สถาบันราชภัฏสวนดุสิตได้เปลี่ยนสถานภาพเป็นมหาวิทยาลัยราชภัฏสวนดุสิต ตามพระราชบัญญัติมหาวิทยาลัยราชภัฏ พ.ศ. 2547 และอาศัยอำนาจตามความในมาตรา 6 และมาตรา 11 วรรคหนึ่ง แห่งพระราชบัญญัติมหาวิทยาลัยราชภัฏ พ.ศ. 2547 รัฐมนตรีว่าการกระทรวงศึกษาธิการจึงออกกฎกระทรวง จัดตั้งส่วนราชการในมหาวิทยาลัยราชภัฏสวนดุสิต กระทรวงศึกษาธิการ พ.ศ. 2548 โดยประกาศในราชกิจจานุเบกษา เล่มที่ 122 ตอนที่ 20ก หน้า 68 ลงวันที่ 8 มีนาคม 2548 คือ ให้จัดตั้งส่วนราชการในมหาวิทยาลัยราชภัฏสวนดุสิต กระทรวงศึกษาธิการ ประกอบด้วย
(1) สำนักงานอธิการบดี
(2) คณะครุศาสตร์
(3) คณะมนุษยศาสตร์และสังคมศาสตร์
(4) คณะวิทยาการจัดการ
(5) คณะวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี
(6) สถาบันภาษา ศิลปะและวัฒนธรรม
(7) สถาบันวิจัยและพัฒนา
(8) สำนักวิทยบริการและเทคโนโลยีสารสนเทศ
(9) สำนักส่งเสริมวิชาการและงานทะเบียน
สำนักงานอธิการบดี จึงได้จัดตั้งขึ้นเป็นส่วนราชการในมหาวิทยาลัยราชภัฏสวนดุสิต มีหน้าที่รับผิดชอบในการสนับสนุนและกำกับดูแลการดำเนินงานระบบบริหารและงานบริการของมหาวิทยาลัย เมื่อพระราชบัญญัติมหาวิทยาลัยสวนดุสิต พ.ศ.2558 มีผลใช้บังคับ ทำให้มหาวิทยาลัยราชภัฏสวนดุสิต ตามพระราชบัญญัติ พ.ศ.2547 เป็นมหาวิทยาลัยสวนดุสิต และสภามหาวิทยาลัยสวนดุสิต ในการประชุมครั้งที่ 1/2558 เมื่อวันที่ 24 กรกฎาคม พ.ศ.2558 ได้ออกประกาศมหาวิทยาลัยสวนดุสิตเรื่องการจัดตั้งส่วนงานของมหาวิทยาลัย พ.ศ.2558 ประกาศ ณ วันที่ 24 กรกฎาคม พ.ศ.2558 และประกาศในราชกิจจานุเบกษา เล่มที่ 132 ตอนพิเศษ 174 ง หน้า 10 – 11 (27 กรกฎาคม 2558) ให้จัดตั้งส่วนงานของมหาวิทยาลัยสวนดุสิต จำนวน 17 ส่วนงาน ซึ่งสำนักงานมหาวิทยาลัย (สำนักงานอธิการบดี เดิม) เป็นส่วนงานใน 17 ส่วนงานดังกล่าว มีภาระหน้าที่ในการบริหารจัดการงานของมหาวิทยาลัยในการสนับสนุน ส่งเสริม ปรับปรุง และพัฒนากิจการของมหาวิทยาลัย ร่วมทั้งการดำเนินการตามวัตถุประสงค์ของมหาวิทยาลัย
สำนักงานมหาวิทยาลัยมีหน่วยงานภายใน ประกอบด้วย
1. สำนักงานเลขานุการสภามหาวิทยาลัย
2. กองกลาง
3. กองกฎหมาย
4. กองคลัง
5. กองนโยบายและแผน
6. กองบริหารงานบุคคล
7. กองพัฒนานักศึกษา
8. กองอาคารและสถานที่
9. กองวิเทศสัมพันธ์
10. กองประชาสัมพันธ์
สำนักงานมหาวิทยาลัย เป็นส่วนงานภายในมหาวิทยาลัยสวนดุสิตที่จัดตั้งขึ้นตามประกาศมหาวิทยาลัยสวนดุสิต เรื่อง การจัดตั้งส่วนงานของมหาวิทยาลัย พ.ศ. 2558 โดยแบ่งออกเป็น 9 หน่วยงาน ตามประกาศมหาวิทยาลัยสวนดุสิต เรื่อง การแบ่งหน่วยงานภายในของส่วนงาน พ.ศ. 2558 , ประกาศมหาวิทยาลัย สวนดุสิต เรื่อง การแบ่งหน่วยงานภายในของส่วนงาน (ฉบับที่ 3) พ.ศ. 2562 และ ประกาศมหาวิทยาลัย สวนดุสิต เรื่อง การแบ่งหน่วยงานภายในของส่วนงาน (ฉบับที่ 6) พ.ศ. 2567 ประกอบด้วย
(1) สำนักงานเลขานุการสภามหาวิทยาลัย
(2) กองกลาง
(3) กองคลัง
(4) กองบริหารงานบุคคล
(5) กองพัฒนานักศึกษา
(6) กองอาคารและสถานที่
(7) กองประชาสัมพันธ์
ภารกิจหลักของสำนักงานมหาวิทยาลัย คือ บริการและสนับสนุนงานด้านบริหารและด้านวิชาการของมหาวิทยาลัย โดยให้บริการงานในแต่ละด้านประกอบด้วย งานพิธีการของมหาวิทยาลัย งานผู้บริหาร งานธุรการ/เลขานุการ งานการเงิน การจัดซื้อจัดจ้างพัสดุ งานบริหารงานบุคคล งานพัฒนานักศึกษา งานสื่อสารประชาสัมพันธ์ งานอาคารและสถานที่ และงานยานพาหนะ รวมถึงงานที่มหาวิทยาลัยมอบหมาย
พันธกิจ
1) สนับสนุน ส่งเสริม การบริหารจัดการอย่างมีระบบ และพัฒนางานบริการให้มีประสิทธิภาพ พร้อมทั้งสร้างความพึงพอใจให้ผู้รับบริการ
2) พัฒนาและปรับปรุงระบบบริหารจัดการตามหลักธรรมาภิบาล
3) ส่งเสริมสนับสนุนบุคลากรของมหาวิทยาลัยและพัฒนานวัตกรรมในการปฏิบัติงานอย่างเป็นระบบเพื่อปรับตัวให้เข้ากับการเปลี่ยนแปลง 4) สร้าง ส่งเสริม ให้มีบรรยากาศที่เอื้อต่อบุคลากรในการทำงานอย่างมีความสุข